《表2 不同浓度地榆醇提物作用下副溶血弧菌中6个内参基因稳定性评价》
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《地榆醇提物对对虾致病菌VP_(AHPND)生长影响及最适内参基因的筛选》
*:对应处理组相应软件给出的最稳定基因
利用5种方法对6个基因稳定性评价的结果见表2。由GeNorm软件给出的内参基因稳定性顺序由大到小为rpo S=16S rRNA>gapdh>rec A>pvu A>pvs A,其中,最稳定的内参基因为16S rRNA和rpo S,其稳定指数均为0.852。由Norm Finder软件计算出的内参基因稳定性顺序由大到小为gapdh>rpo S>pvu A>16S rRNA>rec A>pvs A,最为稳定的内参基因为gapdh,稳定指数为0.584。Best Keeper分析后推荐最稳定的内参基因为16S rRNA,其标准偏差为0.13,这6个候选内参基因稳定性顺序由大到小为16S rRNA>rpo S>gapdh>rec A>pvu A>pvs A。Delta CT法计算得出6个内参基因稳定性顺序由大到小为gapdh>rpo S>pvu A>16S rRNA>rec A>pvs A。其中,最为稳定的内参基因为gapdh,其平均标准偏差的值为1.570。Ref Finder根据上述4个软件的结果分析后得出的综合排名为rpo S>gapdh>16S rRNA>pvu A>pvs A>rec A。
图表编号 | XD00133210900 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.04.01 |
作者 | 杨泽禹、廖梅杰、王印庚、张正、韦信贤、李彬、荣小军 |
绘制单位 | 上海海洋大学水产与生命学院、中国水产科学研究院黄海水产研究所农业农村部海洋渔业可持续发展重点实验室、中国水产科学研究院黄海水产研究所农业农村部海洋渔业可持续发展重点实验室、青岛海洋科学与技术试点国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室、中国水产科学研究院黄海水产研究所农业农村部海洋渔业可持续发展重点实验室、青岛海洋科学与技术试点国家实验室海洋渔业科学与食物产出过程功能实验室、中国水产科学研究院黄海水产研究所农业农村部海洋渔业可持续发展重点实验室、青岛海洋科学与技术试点国家实验室海洋渔业科学与食物产出 |
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