《表4 交集miRNA序列信息》

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《靶向果蝇Kr-h1基因的mi RNA预测及其生物信息学分析》


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注:5p和3p是指成熟miRNA分别从miRNA前体的5′端臂和3′端臂加工而来。

将microT-CDS、Targetscan和miRanda 3个网站预测靶向Kr-h1的miRNA结果进行汇总显示,3个网站共同预测到的miRNA有4个,分别为miR-8、miR-277、miR-927和miR-964,为交集miRNA,见图1,重叠部分为网站预测到相同miRNA的个数。推测miR-8、miR-277、miR-927和miR-964为靶向作用于果蝇Kr-h1基因的潜在miRNA。通过miRBase获取交集miRNA的相关生物学信息,见表4。进一步结合表2~4分析发现,miR-927评分更高,且miR-927与Kr-h1靶向结合位点有2个,其他均为1个。因此,与miR-8、miR-277和miR-964相比,miR-927为潜在靶向Kr-h1基因的miRNA的可能性更大。