《表1 经拓扑学分析筛选原位骨肉瘤和骨肉瘤肺转移后的差异基因》
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《利用生物信息学分析鉴定原位骨肉瘤以及肺转移的信号通路和核心基因》
通过STRING数据库(http://string-db.org)构建骨肉瘤及骨肉瘤肺转移中DEGs表达产物的PPI网络,总共662个,包括234个上调基因和428个下调基因。在去除分离和部分连接的节点后,通过软件Cytoscape构建了一个复杂的DEGs网络。通过节点之间连接数目,截去连接点6及6以下的节点,显示出显著相互作用的137个最重要的基因(表1),在去除连接点小于6的节点后,利用Cytoscape构建DEGs网络(图2)。通过R-heatmap软件用于绘制经拓扑分析后的137个上调和下调基因的热图(图3)。
图表编号 | XD0049565100 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.02.10 |
作者 | 李浩江、陈茂强、王振勇、付海涛、眭翔、郭全义、王桂琴 |
绘制单位 | 山西医科大学微生物学与免疫学教研室、山西医科大学微生物学与免疫学教研室、中国人民解放军总医院骨科再生医学北京市重点实验室、全军骨科战创伤重点实验室、中国人民解放军总医院骨科再生医学北京市重点实验室、全军骨科战创伤重点实验室、中国人民解放军总医院骨科再生医学北京市重点实验室、全军骨科战创伤重点实验室、中国人民解放军总医院骨科再生医学北京市重点实验室、全军骨科战创伤重点实验室、山西医科大学微生物学与免疫学教研室 |
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