《表2 3个地区的棘胸蛙样本SNP结果统计》

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《福建内陆山区棘胸蛙遗传多样性分析》

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对3个地区棘胸蛙所获得的SNP进行统计汇总（表2），为确保鉴定得到的SNP的质量，对检测到的SNP进行过滤：（1）异置信度与质量深度的比值≥2；(2）使用Fisher's精确检验来检测链偏倚现象而得到的Fhred格式的p值，本试验设置为≤60；(3）均方根值比对质量值≥40；(4）变异非参检验、秩和检验的零-均值（Zscore）和比对序列质量值的比值≥-12.5；(5）变异非参检验、秩和检验的零-均值（Zscore）和比对序列位置偏差的比值≥-8.0。最终经过过滤，3个地区的棘胸蛙样本共获得396 969个SNP位点，其中龙岩群体获得SNP位点数最多，为139 169个；三明群体最少，为123 437个SNP位点。经过再次筛选检测，3个地区的棘胸蛙样品共获得8 615个共有SNP位点用于高级分析。