《表1 样品的检测结果:miR-30a对肺腺癌A549细胞转录组水平变化的影响》

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《miR-30a对肺腺癌A549细胞转录组水平变化的影响》


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采用q PCR检测高通量测序样品是否制备成功(mi R-30a的表达量以U6的表达量做归一化处理)。由图3A、图3B可知,空白组的表达量为(1.006 7±0.6658),NC组表达量为(1.666 7±0.115 9),mi R-30a过表达组表达量为(31.130 0±0.572 6),转染mi R-30a组中mi R-30a的表达量均高于空白组和阴性对照组(P<0.01);空白组和阴性对照组比较,差异无统计学意义(P>0.05),提示高通量测序样品制备成功。采用分光光度计测定提取RNA的浓度和质量,实验结果显示样品的OD值均在1.8~2.0之间,见表1。琼脂糖凝胶电泳检测条带清晰可见(图3C),表明3个组中提取RNA的质量良好。转录组高通量测序的RNA样品间基因表达水平相关性的分析结果可知皮尔逊相关系数的平方(R2)几乎都接近于1,表明实验可重复性高,样品可靠(图3D)。安捷伦2100检测结果可知,RIN值≥7、28S/18S≥1(图3E~图3G),提示RNA完整性好,RNA提取成功,样品可进行高通量测序。