《表3 PPP3CA基因群体遗传参数》
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《PPP3CA基因多态性与江口萝卜猪肉质性能关联性分析》
注:χ20.05(2)=5.99,χ20.01(2)=9.21;PIC>0.5为高度多态,0.25由表3可知,A-918C位点等位基因分布较均匀;而G154767A和G316451A位点等位基因频率差异大,GG为优势基因型,G为优势等位基因,等位基因频率分别为0.772 7和0.767 9,表明群体内变异程度较低,等位基因分布不均匀。3个位点PIC均为中度多态,可以提供一定的遗传信息。χ2检验显示A-918C位点和G316451A位点处于HardyWeinberg平衡,G154767A位点极显著偏离HardyWeinberg平衡,表明该位点可能存在选择或遗传漂变。2.4单倍型、双倍型分析以及连锁不平衡分析对检测到的3个SNPs位点进行连锁不平衡分析。根据D’值和r2判断位点之间是否存在连锁,其中D’=1为完全连锁,D’=0为无连锁或连锁平衡,r2=1为完美连锁,r2>0.33提示为强连锁,r2=0为无连锁或连锁平衡。由图3可知,3个位点之间无强连锁不平衡。单倍型和双倍型分析结果见表4,舍去频率低于0.03的单倍型和双倍型,共有7种单倍型和8种双倍型,其中H3(AGG)为频率最高的单倍型,H3H3为频率最高的双倍型。
图表编号 | XD00216222800 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2021.01.10 |
作者 | 王兴群、毛以智、张继、吴雪、邱淦远、刘鹏程、杨茂林、刘若余 |
绘制单位 | 遵义职业技术学院、贵州省动物疫病预防控制中心、贵州大学动物科学学院高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室、贵州大学动物科学学院高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室、贵州大学动物科学学院高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室、贵州大学动物科学学院高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室、贵州省江口县科技局、贵州大学动物科学学院高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室 |
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