《表2 S基因突变统计：新型冠状病毒进化与变异》

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《新型冠状病毒进化与变异》

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新冠病毒的数据库有2019新型冠状病毒信息库、全球流感病毒数据库（Global Initiative on Sharing All Influenza Data，GISAID）和Gen Bank数据库等。本文所下载的新冠病毒相关序列均来源于Gen Bank数据库。从Gen Bank数据库搜索到334条来自部分欧洲国家的新冠病毒序列（截至2020年7月14日）。多序列比对结果显示，S基因共有51个位点发生了突变（图3）。其中在1 841位点的A-G转换突变最为常见，共有262条S基因序列发生该突变，突变率高达78.4%，仅在1 841位点发生点突变的序列有220条，变异率为66%。从所有发生突变的S基因来看，共有51种变异模式，其中单点突变的模式有16种；有4种双突变模式，如第42、43种模式上，782位点的碱基与1 358位点的碱基一起突变（图3）。在统计的334条S基因序列中，未发生突变的序列共有46条，比例为14%；1个位点发生突变的序列有239条，比例为72%；2个位点发生突变的序列有41条，比例为12%；3个位点发生突变的序列有8条，比例为2%。S基因序列发生突变的总比例高达86%。新冠病毒S基因在流行过程中单条基因序列突变不大，最多出现3个碱基的突变（表2）。