《表1 晋南驴遗传多样指数》

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《晋南驴mtDNA D-loop区部分序列系统进化分析与体型测定》


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注:H:单倍型多样度;SD:标准差;Pi:核苷酸多样度;K:样本中所有单倍型对两两间的平均核苷酸差异数

家驴mtDNA基因组总长度16 670 bp,其中D-loop区的总长度为1 207 bp,GenBank的登录号为X97337。本研究对晋南驴99个样本的mtDNA D-loop部分序列进行测序,长度共为480 bp。以X97337为对照,研究所测得序列核苷酸位置介于15 485~15 785(D-loop序列22~322)和15 946~16 126(D-loop序列483~663)之间,利用ClustalX软件进行序列比对,结果显示:99个序列4个核苷酸A、C、T、G的含量分别为29.8%、14.2%、30.3%、25.6%,全部碱基中G+C含量为39.8%,A+T含量为60.2%,其中57个位点发生转换,40个位点发生颠换。用Dnasp4.10进行遗传多样性分析,结果表明:本研究测定晋南驴群的单倍型多样度、核苷酸多样度和碱基对平均差异数分别为0.867±0.034、0.0270 7、9.640(表1),表明晋南驴品种具有丰富的遗传多样性。