《表2 菌棒微生物多样性指数》

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《基于高通量测序的贵州铜仁黑木耳菌棒污染真菌的多样性分析》


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根据97%相似性水平下的OUT信息,采用Alpha多样性指标的Ace、Chao、Shannon、Simpson及Coverage指数对样品微生物物种丰富度、多样性及覆盖度进行评估,结果见表2。从稀释曲线可以反映样品在不同测序数量时的微生物多样性,当曲线趋向平坦时,说明测序数量足够大,可以反映样品中绝大多数的微生物信息。由图2可以看出所有样品的曲线都随着横坐标而逐渐稳定,说明测序数据量合理,所含菌种数较多。此外,从分类水平为OUT进行Coverage指数分析,Coverage指数均达到99%以上,说明样品中序列未被测到的概率较低。