《表2 菌棒微生物多样性指数》
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《基于高通量测序的贵州铜仁黑木耳菌棒污染真菌的多样性分析》
根据97%相似性水平下的OUT信息,采用Alpha多样性指标的Ace、Chao、Shannon、Simpson及Coverage指数对样品微生物物种丰富度、多样性及覆盖度进行评估,结果见表2。从稀释曲线可以反映样品在不同测序数量时的微生物多样性,当曲线趋向平坦时,说明测序数量足够大,可以反映样品中绝大多数的微生物信息。由图2可以看出所有样品的曲线都随着横坐标而逐渐稳定,说明测序数据量合理,所含菌种数较多。此外,从分类水平为OUT进行Coverage指数分析,Coverage指数均达到99%以上,说明样品中序列未被测到的概率较低。
图表编号 | XD00170123100 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.07.23 |
作者 | 刘尧、冮洁、邓海平、曲鹏坤、袁家诚、宋文俊 |
绘制单位 | 大连民族大学生命科学学院生物技术与资源利用教育部重点实验室、大连民族大学生命科学学院生物技术与资源利用教育部重点实验室、铜仁科学院梵净山生物资源研究所、大连民族大学生命科学学院生物技术与资源利用教育部重点实验室、大连民族大学生命科学学院生物技术与资源利用教育部重点实验室、铜仁科学院梵净山生物资源研究所 |
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