《表4 PD组FC值最高的25个不同表达的mRNA(与对照组比较)》

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《新疆地区汉族帕金森病患者基因组长链非编码RNA的差异表达谱筛查分析》


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基于对筛选出的291个差异表达的lncRNA探针的功能大部分仍不清楚。本实验通过对其共表达mRNA的注释预测其潜在功能。首先,通过微阵列芯片检测lncRNA-PD亚组和lncRNA-对照亚组(各5例)的全基因组mRNA的表达谱。同样以校正后的P<0.05和绝对倍数变化(FC)>2为标准,识别差异有显著统计意义的mRNA。在检测到的34 000个mRNA探针中,共发现427个mRNA差异表达有显著统计学意义(图2A)。其中,332个mRNA表达上调,95个mRNA表达下调。PD组FC值差异表达mRNA前25位见表4。由这些差异表达的mRNA产生的散点图和火山图在两组之间明显分离,差异有显著统计学意义(图2B~C)。每个点代表1个mRNA。红点为上调mRNA(FC值>2,P<0.05),绿点为下调mRNA(FC值<-2,P<0.05),黑点为其余mRNA(-20.05)。这一结果表明PD组与对照组的mRNA差异表达比较差异有统计学意义。