《表2 肠杆菌属细菌一类整合子基因盒》

《表2 肠杆菌属细菌一类整合子基因盒》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《肠杆菌属细菌一类整合子及其基因盒特征》


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一类整合子可以捕获外源基因,整合到整合子的可变区。对25个含一类整合子细菌分析表明,氨基糖苷类抗生素抗性基因被捕获得最多,包括aadA1、aadA2、aadA16、aadB、aacA4、aacA7、aacA27、aacC1、aacC2、aac(3)-Via(aac3)、aacC4和aacC6;其次是磺胺类抗生素抗性基因dfrA1、dfrA14、dfrA15、dfrA17、dfrA27和dfrB13,其中频率最高的是甲氧嘧啶抗性基因dfrA14。甲氧嘧啶常与磺胺抗生素联合使用以增强药效,在1960年代投入使用。到目前为止,已在Actinobacillus pleuropneumoniae、Escherichia coli等多个菌株质粒或染色体上发现dfrA14基因(Kayode et al.,2002;Janine et al.,2015),它是基因盒的一部分。其他基因有β-内酰胺类抗生素抗性基因blaIMP4、blaIMP8和blaVIM-4,喹诺酮类抗生素抗性基因qnr A1、qnrB6,氯霉素抗性基因catB3,利福平抗性基因arr和红霉素抗性基因ereA等。被捕获基因以不同组合形式串联起来形成基因盒阵列,分析表明25个含一类整合子细菌上的36个整合子存在18种基因盒(表2),以dfrA14基因盒最为常见,16.13%(10/62)菌株携带该类基因盒。值得一提的是,这种基因盒与整合子In(pHCM1)基因盒相似(Partridge et al.,2001),其后均存在一个插入序列IS6100,使得这种整合子缺乏3'-CS。这种基因盒也存在于临床Klebsiella pneumoniae菌质粒(pK245,DQ449578)的整合子上(Chen et al.,2006)。aadA1基因盒存在于4个阴沟肠杆菌(E.cloacae 1311,E.cloacae 1411,E.cloacae 1669,E.cloacae AR0163)和一个霍氏肠杆菌Enterobacter hormaechei CAV1176中(8.06%,5/62);基因盒aacA27-ereA-IS1247-aac3-arr2-ereA则存在于本研究中的霍氏肠杆菌Enterobacter hormaechei subsp.steigerwaltii34997和Enterobacter hormaechei SCEH020042),以及阴沟肠杆菌Enterobacter cloacae AR 0365中(4.84%,3/62)。研究表明,Klebsiella oxytoca、Enterobacter cloacae和Salmonella enterica(GU067641)等细菌中也存在该基因盒(Krauland et al.,2010)。aacA4-arr3-dfrA27-aadA16基因盒存在于234和388两株阴沟肠杆菌中(3.23%,2/62),其他基因盒则仅存在于1个细菌中(1.61%,1/62)。插入序列共同区(ISCR)被认为是强大的抗生素抗性基因捕捉和移动系统,在抗生素抗性基因的出现与传播中起重要作用。E.cloacae colR/S、E.cloacae ECNIH2和Enterobacter hormaechei subsp.steigerwaltii 34998各有一个整合子其基因盒分别存在ISCR元件,表明该整合子是复合一类整合子。同一基因盒存在于多个不同细菌中,可能预示着这些基因盒具备水平基因转移能力。