《表3 血浆和尿液中人血清白蛋白修饰的类型和数量的比较》
注:PSM即peptide-spectrum matching,指通过搜库得到质谱谱图与肽段的比较结果
通过分析发现,尿蛋白中修饰位点的平均数为10000,而血浆中的修饰位点的平均数为6000.在血浆中,赖氨酸(Lys,K)的氨甲酰化量显著高于尿液,而尿液中蛋白质中Cys的脱巯基化(-SH)变成脱氢丙氨酸(Dha)的量要比血浆高得多.表3以样品中主要的高丰度蛋白质人血清白蛋白(human serum albumin,HSA)为例,统计了质谱鉴定的结果和修饰信息.数据经过搜库比对与分析后,会给出每种蛋白质的鉴定覆盖率,其值越高,提示蛋白质碎片的“复原”程度越高.经对样品统计,在血浆中HSA的鉴定覆盖率为93.5%±1.1%,尿液中为85.6%±2.3%,依靠对样品中白蛋白的质谱鉴定覆盖率进行归一化,并对每种发现修饰所占总肽段数的进行计算统计,算法如下:占总肽段数的比例=修饰数量÷样品中多肽鉴定总量×鉴定覆盖率,图2展示了血浆和尿液中白蛋白的几种修饰情况比较.
图表编号 | XD00133795600 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.03.20 |
作者 | 刘永涛、赵敏迪、潘宣圳、高友鹤 |
绘制单位 | 北京师范大学生命科学学院生物化学与分子生物学系基因工程药物及生物技术北京市重点实验室、北京医院国家老年医学中心检验医学科、北京师范大学生命科学学院生物化学与分子生物学系基因工程药物及生物技术北京市重点实验室、北京师范大学生命科学学院生物化学与分子生物学系基因工程药物及生物技术北京市重点实验室 |
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