《表2 参试的18个宝巾花品种》

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《宝巾花基于转录组测序的SSR标记的开发和应用》

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随机选择重复基序为2～6个碱基的147个SSR位点并合成前向和后向引物。利用水红宝巾花、绿叶白花宝巾花（B.spectabilis Wild.'Auratus'）、金心宝巾花（B.×spectoglabra'Thimma'）和皱叶深红宝巾花（B.×buttiana'Barbara Karst'）等4种（或杂种）的DNA样品，经PCR优化，发现147个SSR中有效扩增的位点为50个（34.01%）。利用18个宝巾花品种的DNA（表2），对这50个位点进行多态性检测，结果共获得16个多态性SSR位点（即SSR标记）（表3；表4）。说明多态性位点的比例较低，可能与转录组序列的保守性较高、SSR变异水平较低有关。因RNAseq序列也是EST，其所含的SSR亦可称为EST-SSR，故所开发的标记命名为BOUeSSRxx（BOU为属名前3个字母，eSSR表示EST-SSR，xx为2位数字序号）。