乙脑病毒的宿主范围尚未完全明确。课题组在前期研究中发现中国某些地区的某些种类蝙蝠可携带乙脑病毒，提示应深入研究蝙蝠在乙脑病毒循环中的作用。该项目研究内容：①不同地区蝙蝠携带乙脑病毒情况调查；②蝙蝠、猪和蚊子来源乙脑病毒株的种系发生分析；③实验室条件下蝙蝠感染乙脑病毒的实验研究。研究表明海南、广东和湖南省的蝙蝠均能检测到乙脑病毒，阳性率为2.0%-3.7%。对8株蝙蝠乙脑病毒株以及GenBank中的有代表性的乙脑病毒株的基因和氨基酸序列进行了比较和分析，结果表明不同年代、不同地区分离的蝙蝠乙脑病毒株的基因和氨基酸序列相似性很大，为99.4%-99.9%，处于同一个进化支上，属于GIII型。蝙蝠乙脑病毒株的相似性远高于人、蚊和猪乙脑株的相似性。值得注意的是，进化树分析显示蝙蝠乙脑病毒株与中国分离的蚊乙脑病毒株BN19、人乙脑病毒株Liyujie和乙脑病毒原型株Nakayama同在一个分支上，基因序列和氨基酸序列有较大的相似性。致倦库蚊和白蚊依蚊均吸蝙蝠血。蝙蝠乙脑病毒能在致倦库蚊和白蚊依蚊体内增殖。该研究提示蝙蝠可能参与自然界中乙脑病毒的循环。

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