《表1 各种SNP检测技术对比分析》

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《高通量自动化SNP检测技术研究进展》

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传统经典的SNP检测方法由于自身的局限性已经很少被应用，高通量自动化的SNP检测技术已经取得了一定进展，各种SNP检测技术的优缺点对比分析详见表1。除以上叙述的几种代表性高通量自动化检测方法外，还有变性高效液相色谱（DHPLC）、高分辨率熔解曲线（HEM）等高通量自动化检测方法，对于不同的实验环境，都有各自的检测适用范围。一个完善的SNP检测方法应有一定的综合优势，包括:检测原理要清晰严谨；通量大，具有一定的自动化规模；检测准确性高、特异性好；操作简便快速、检测成本低、耗时短；不仅能够检测出已知的SNP位点，还能够为发现新的SNP位点提供可能。目前，国内外的SNP检测方法中，还没有哪一种方法完全符合上述要求。比较而言，基因芯片法是相对较为理想的一种方法，尽管还存在着诸如探针设计特异性、背景干扰等一些不足，但其在检测SNP方面具有独特优势，伴随着相关技术的结合和方法的改进，已经使得基因芯片法越来越完善。Sedighi等[102]利用金纳米颗粒（AuNP）辅助基因芯片检测基因组DNA样本中的SNP，提高了检测灵敏度。Saka等[103]开发一种新的算法，解决了Affymetrix GeneChip数据分析的三个问题:去除非特异性探针；根据最新的基因组知识更新探针目标图谱；将探针进行分组。