《表5 基因结构及位置优化》

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《基于RNA-Seq技术的葡萄不同花型新转录本预测和基因结构优化》

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5′/3′:表示为+/-链方向。部分数据未列出。

由于有关数据和生物信息学软件的局限性，导致葡萄的基因功能和位置信息不够精确。为此我们利用RNA-Seq测序数据对已注释的基因结构进行进一步确认和优化。如果在已注释基因边界之外的区域有连续的匹配读段支持，则将基因的非翻译区（untranslated region，UTR）向上游或下游延伸，对基因的边界进行修正。共13 956个基因结构进行了优化，其中3′端6 765个，5′端7 151个，+链7 013个，-链6 853个（表4）。在不同染色体上随机选取1个基因作为代表，将原位置与优化后的位置进行了统计（表5）。