《表2 真实生物数据片段》

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《无间隙约束下无重叠模式匹配的在线求解算法》


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本节主要对比了INSNGP、NETNGP、SNGP-Slow、SNGP-Best四个算法的时间性能,考虑了模式长度和序列长度两个因素进行实验,实验序列和模式分别是表2和表3中的数据,分别求上面几个算法的运行时间,每个模式在同一序列上运行50次,实验结果采用运用公式(1)求取平均值,并将每个模式在8个序列上的运行时间求和,结果如图3所示.