《表2 与M蛋白互作的宿主细胞蛋白》
注:N/A为功能未知的蛋白.
PEDV DR13感染细胞36 h后,收集细胞样品,留取部分样品,通过Western blot检测M蛋白的表达水平(图2A)。其余样品进行免疫沉淀实验,取免疫沉淀后的部分样品进行SDS-PAGE电泳,对凝胶进行银染显色。从凝胶上可以清晰的看到:与阴性对照相比,免疫沉淀后,PEDV感染组鉴定到了更多的蛋白条带(图2B)。将40μL样品经LC-MS/MS质谱分析后,PEDV感染组与细胞对照相比,去除细胞对照鉴定到的蛋白,PEDV感染组共鉴识出218个细胞内源性蛋白,其中唯一肽段数≥2的蛋白有62个(表2)。GO功能富集分析(图3)显示鉴定到的蛋白分别参与了细胞生物学过程,其中27%的蛋白参与了多肽代谢过程,26%的蛋白参与了翻译过程,27%的蛋白参与了多肽生物合成过程。分子功能分析显示,鉴识出的蛋白具有结合能力和酶活性。细胞位置分析结果显示与M蛋白互作的宿主蛋白主要分布于细胞质、大分子复合体以及核糖体等部位。
图表编号 | XD0078215900 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.06.20 |
作者 | 王瑞阳、于瑞嵩、陈冰清、李凤平、谢春芳、司伏生、董世娟、李震 |
绘制单位 | 上海海洋大学水产与生命学院、上海市农业科学院畜牧兽医研究所、上海农业遗传育种重点实验室、上海种猪工程技术研究中心、上海市农业科学院畜牧兽医研究所、上海农业遗传育种重点实验室、上海种猪工程技术研究中心、上海市农业科学院畜牧兽医研究所、上海农业遗传育种重点实验室、上海种猪工程技术研究中心、上海海洋大学水产与生命学院、上海市农业科学院畜牧兽医研究所、上海农业遗传育种重点实验室、上海种猪工程技术研究中心、上海市农业科学院畜牧兽医研究所、上海农业遗传育种重点实验室、上海种猪工程技术研究中心、上海市农业科学院畜牧兽医 |
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