《表5 古茶树SLAF标签统计结果》

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《基于SLAF-seq技术的古茶树SNP位点开发》


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测序总深度:对应样品在SLAF标签中的测序总深度,即总reads数。平均深度:平均每个SLAF上对应样品的测序reads数。Total depth:total sequencing depth of corresponding samples in SLAF tags,which is total reads number.Average depth:average sequencing reads number of

本试验中,古茶树样品平均测序深度为24.21×(表5),通过生物信息学分析,共开发1 656 258个古茶树SLAF标签,其中462 897个多态性SLAF标签。利用得到的多态性SLAF标签进一步进行SNP位点的开发,共得到2 690 638个群体SNP标记。根据完整度大于0.8且MAF大于0.05的标准进行过滤,共得到283 376个高一致性的群体SNP标记,SNP信息统计结果见表6。