《表4 古茶树及对照测序结果》

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《基于SLAF-seq技术的古茶树SNP位点开发》

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为保证分析质量，采用读长100 bp×2作为后续的数据评估和分析数据。为评估试验建库的准确性，以日本晴水稻的数据为对照，经Illumina HiSeqTM 2500测序平台测序，共获得310.10 Mb读长数据（表4），各样品所获得的读长数为1 279 534～8 460 233，其中，来源于贵阳花溪久安的HJ10样品所获得数据量最大，为8 460 233个读长，对照日本晴水稻数据量最小，为1 279 534个读长。测序质量值Q30为92.61%～94.88%，均值为93.84%，其中，来源于贵州安顺的N645样品Q30测序值最小，仅为92.61%，来源于贵阳花溪久安乡的HJ02样品的Q30测序值最大，为94.88%。所有样品Q30值均在90%以上，说明测序碱基错误率低，所获数据合格。测序获得GC比例为43.52%～47.18%，其中，对照日本晴水稻的GC比例最大，为47.18%，来源于贵阳花溪久安乡HJ04样品的GC比例最小，为43.52%。GC比例均值为43.99%，GC比例普遍不高，说明达到测序要求。