《表2 环状RNA数据库》

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《环状RNA与头颈部肿瘤》


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环状RNA在疾病中作用机制的研究是时下的热点。用于检测环状RNA表达及其功能研究的方法有很多。可以通过RNA测序和微阵列筛选目标环状RNA,然后利用逆转录-聚合酶链反应,液滴数字PCR,RNA印迹和荧光原位杂交进行验证。通过过表达或敲除实验进行环状RNA功能研究。结合生物信息学,RNA免疫共沉淀和RNA质谱进行机制研究。目前,已经开发了很多的数据库和分析工具供研究者使用(表2)。CircInteractome具有环状RNA引物和干扰RNA设计功能。ExoRBase用于分析血液外泌体中特异性环状RNA分子。通过这些免费工具,我们可以分析组织、血液、外泌体中环状RNA的差异表达,预测与之结合的miRNA,研究环状RNA分子具有的功能。