《表1 SSR位点在甜叶菊EST数据库中出现的频率》

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《甜叶菊EST序列特征分析与分子标记开发》


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注:a:重复基元数目/重复类型总数;b:重复基元数目/总EST数目类型

甜叶菊EST-SSR重复序列的长度主要在20~28 bp之间,在此区域内含有74条SSR位点序列,约占全部含SSR位点序列的84.1%。在本研究中共发现88个SSR位点序列,不同类型基序出现的频率存在明显的偏倚性。其中六核苷酸出现次数最多共有56个,占全部SSR的63.7%,出现频率为0.99%,每29.51 kb就出现1个;三核苷酸次之,有19个,占21.6%,出现频率为0.32%,平均86.99 kb出现1次;二核苷酸为10个,占11.4%,出现频率为0.18%,平均165.27 kb出现1次;五核苷酸和四核苷酸数目最少,分别是2和1个(表1)。