《表1 怒江红山茶转录组SSR位点的分布》

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《基于高通量测序的怒江红山茶微卫星位点特征分析》

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在怒江红山茶转录组中，SSR类型比较丰富，对1～6 bp的SSR重复单元类型进行统计（表1），重复单元类型以二核苷酸为主，其次是三核苷酸和单核苷酸，四、五、六核苷酸的重复单元较低，但是五核苷酸的重复单元类型高于四核苷酸和六核苷酸的重复单元（图1）。若在不考虑单核苷酸的情况下，二、三核苷酸占总数的92.70%，四核苷酸重复最少。各重复单元类型的出现频率和SSR分布的平均距离也均有差别（图1）。其中二核苷酸SSR比例及频率最高（59.50%，13.80%），SSR分布的平均距离最小（53.81 k B）；四核苷酸SSR比例及频率最低（1.29%，0.30%），SSR分布的平均距离最大（2 486.74 kB）。各重复单元类型的SSR数量和出现频率的变化规律为:二核苷酸>三核苷酸>单核苷酸>五核苷酸>六核苷酸>四核苷酸；不同重复类型核苷酸的平均距离各不相同，依次为:二核苷酸<三核苷酸<单核苷酸<五核苷酸<六核苷酸<四核苷酸，可以看出SSR位点的出现频率或数量越高，其平均距离就越小，分布密度就越大。