《表2 款冬转录组SSR位点的数量及分布》

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《款冬转录组SSR标记开发及其多态性研究》

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对款冬转录组数据长度大于1 kb的18 938条unigene（总碱基37 406 030 bp）进行SSR位点搜索，在3 844条unigene中检出4 688个SSR位点，SSR发生频率（含SSR的unigene数与总unigene数之比）为20.30%，出现频率（检出SSR数与总unigene数之比）为24.75%，平均每7 979 bp出现1个SSR。其中3 562条unigene只包含单个SSR位点，680条unigene含有2个或2个以上的SSR位点，以复合物形式存在的SSR位点有219个。款冬转录组SSR类型丰富，单核苷酸至六核苷酸重复类型均存在，但各类型数量不同，其中三核苷酸重复最多，占总SSR的37.12%，其次是单核苷酸和二核苷酸重复类型，分别占32.36%和28.20%，单、二及三核苷酸重复占优势，三者之和达97.68%；四、五、六核苷酸重复类型的数量极少，分别占总数的1.69%、0.30%和0.34%，总计为2.33%（表2）。