《表1 HMGB1 SNPs引物序列》

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《HMGB1基因多态性与豫北地区肺结核易感性的相关性》


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选择rs1412125(-1615A/G)、rs1045411(+1177G/A)、rs2249825(+3814C/G)三个位点,都是常见SNPs,这些SNPs的次要等位基因频率均≥5%。rs1412125、rs1045411、rs2249825引物序列见表1。PCR扩增体系共26μL,包括2×PFUMasterMix12.5μL(北京康为世纪生物科技有限公司)、去离子水10.5μL、上下游引物各1μL、DNA1μL。HMGB1rs1412125扩增条件为:94℃5 min的初始变性,然后是94℃30 s,55.9℃30 s,72℃2 min,共循环35次,最后在72℃延伸5 min;HMGB1 rs1045411扩增条件为:94℃5 min的初始变性,然后是94℃30 s,55℃30 s,72℃2 min,共循环35次,最后在72℃延伸5 min;HMGB1 rs2249825扩增条件为:94℃5 min的初始变性,然后是94℃30 s,57.6℃30 s,72℃2 min,共循环35次,最后在72℃延伸5 min。所有的PCR产物经1%琼脂糖凝胶电泳鉴定,确定扩增目的产物的有无。扩增产物送公司进行测序,测序结果通过DNASTAR V7.0软件记录相应的SNPs位点。