《表1 HMGB1基因多态性引物设计》

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《PD-1、TIM-3及HMGB1基因多态性在老年肺结核病人中的表达及与肺功能的相关性研究》


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采用高通量测序法完成HMGB1基因的单核苷酸多态性(SNP)位点检测,分析2组SNP基因型、等位基因频率存在的差异。(1) SNPs的挑取:查阅生物信息数据库,结合既往研究报道确定HMGB1基因rs1045411、rs2249825、rs1412125 3个SNPs;(2)基因序列的确定:参考Genebank获得HMGB1基因多态性引物序列,见表1;(3) DNA扩增反应条件:设置PCR参数为30℃10 min,42℃30 min,99℃5 min,5℃下5 min,连续进行35个循环,72℃10 min延长,获得最终产物并放入1.5%琼脂凝胶电泳,β-actin为内对照;(4)测序:配置浓度为2%琼脂糖凝胶,将PCR扩增产物与凝胶充分混合、电泳,给予溴乙锭染色并完成电泳,拍照[10]。