《表1 puf M基因的引物类型》

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《水域生境好氧不产氧光合细菌(AAPB)研究进展》

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目前，关于水环境中AAPB的检测方法主要包括实时荧光定量PCR法（q PCR）[29]、红外快速脉冲速率（IRFRR）诱导荧光瞬态动力学法[20]、红外荧光显微镜法（IREM）[30]、高效液相色谱法（HPLC）[31]和基于时间序列观察的蓝藻校准红外荧光显微镜法（TIREM）[32]．其中，q PCR方法是基于对功能基因puf M（编码光化学反应中心的小亚基）进行系统发育分析来研究AAPB物种组成，但该方法的局限性在于AAPB菌群中某些种类未完全被认知，其在引物设计方面存在不足之处，不能够直接估算出AAPB丰度，puf M功能基因扩增相关引物见表1.IRFRR、IREM、HPLC和TIREM这4种方法均是基于BChl.a的红外荧光作为诊断信号来对AAPB进行检测．但由于AAPB细胞内BChl.a浓度低，且易受叶绿素的红外干扰，因此IRFRR和IREM方法都不能准确定量AAPB；而HPLC方法虽然能够对色素进行定性定量研究，但无法研究AAPB占细菌总数的比例；TIREM方法则不仅能够精确定量AAPB，并且能够解决AAPB所占细菌总数比例的问题．