《表1 样品转录组clean data统计》

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《粗茎秦艽种子萌发过程的转录组及关键因子分析》


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raw data为原始测序序列;clean data为去除接头、无法确定碱基信息及低质量reads的序列数据;clean bases为测序序列的长度;Q30为碱基正确识别率达99.9%的序列比例;GC含量为碱基G和C占总的碱基数量的百分比

对粗茎秦艽种子的132 532 476条转录组raw data进行过滤,各样品的clean bases为5.99~6.80Gb,Q30均在94.71%以上,GC含量平均值为43.71%(表1)。取每条基因中最长的转录本为Unigene,共获得149 463条Unigene,平均长度为601.88 bp,N50为909,长度在1 kb以上的有22 147条,表明组装结果较可靠。