《表2 各样品的clean data统计》

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《基于转录组测序揭示适度干旱胁迫对丹参基因表达的调控》

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过滤原始数据后，各样品的clean data均达到5.96 Gb，Q30碱基百分比在95%以上，且GC含量均在50%左右，见表2。将clean reads进行组装共得到58 085条Unigene，Unigene的N50为1 778，其中长度在1 kb以上的Unigene有14 367条，占Unigene总数的67.08%，表明组装的完整性较高。通过选择BLAST参数E值≤1×10-5和HMMER参数E值≤1×10-10，最终获得28 846个有注释信息的Unigene，约占Unigene总数的49.66%。Unigene与Nr数据库的BLAST比对结果见图1，其中丹参转录组测序得到的Unigene与芝麻Sesamum indicum L.基因的同源性最高，达到30.91%，而与丹参直接比对上的Unigene只有757条，占总数的2.73%，表明目前能获得的丹参基因的注释信息还较少。