《表2 奇数和偶数组探针pull-down的蛋白》
*与特异肽段匹配=1的亚群相比,P<0.05
在蛋白质谱的检测过程中,随着LC-MS/MS上机时间的延长,会检测出相对低丰度的蛋白,得到更多种类的蛋白。本研究在进行LC-MS/MS质谱分析时在原有基础上多加1个h上机时间,此条件下奇数探针组和偶数探针组的检测到蛋白总数分别为650种和508种,这两组探针检测的共同蛋白434种。分析二组实验中不同肽段覆盖的蛋白中的假结合蛋白比例,结果显示在奇数探针组和偶数探针组特异肽段匹配=1的蛋白数量约占总鉴定蛋白数量的40%,而特异肽段匹配=1中的假结合蛋白比例明显高特异肽段匹配≥2的亚群(表2)。该结果提示,延长LC-MS/MS上机检测虽然可以增加低丰度蛋白的检出,但同时也增大了非特异结合的比例,实验要根据目的选择合适的时间设定。
图表编号 | XD0019670700 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2018.02.25 |
作者 | 苏中静、宋旭红、常晓兰、黄东阳 |
绘制单位 | 汕头大学医学院组织学与胚胎学教研室、汕头大学医学院细胞生物学教研室、汕头大学医学院细胞生物学教研室、汕头大学医学院细胞生物学教研室 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |