《表2 膜结合AtbHLHs和ZmbHLHs的详细信息》
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《拟南芥和玉米中膜结合bHLH转录因子的鉴定与分析》
我们对166个拟南芥及206个玉米b HLH家族成员进行了MTF的预测,一共预测到58个假定的MTFs,其中膜结合AtbHLHs有22个,膜结合ZmbHLHs有36个。在5个网站预测到的结果中,HMMTOP网站预测到的MTFs数目最多,TMHMM2.0网站预测到的MTFs数目最少。如表1所示,在两个及两个以上网站中同时预测到的MTFs中包含4个AtbHLHs和8个ZmbHLHs,其中AtbHLH158(AT5G57150)和ZmbHLH36(GRMZM2G065374)在5个网站中都预测到跨膜区。为了研究MTFs的跨膜结构域位置,我们对58个假定的MTF进行了跨膜区分析,发现大多数MTFs只有1个跨膜区(20个AtbHLHs和29个ZmbHLHs),有3个AtbHLHs和7个ZmbHLHs含有2个跨膜区。另外,我们发现58个MTFs的亲水性平均系数均小于0,说明58个MTFs为亲水性蛋白;22个AtbHLHs基因编码163~623个氨基酸,蛋白质分子量大小约为18.69~67.95 kDa,等电点约为5.02~9.87。染色体定位分析发现它们分别位于拟南芥的5条染色体,其中在两个及两个以上网站中同时预测到的4个AtbHLHs基因分别位于1、4和5号染色体;36个ZmbHLHs基因编码252~898个氨基酸,蛋白质分子质量约为27.57~100.42 kDa,等电点约为4.79~9.22(表2)。36个ZmbHLHs基因分别位于玉米的10条染色体,其中1号和10号染色体上的膜结合ZmbHLHs数目最多(6个),在两个及两个以上网站中同时预测到的8个ZmbHLHs分别位于除6和9号染色体以外的8条染色体上;同时我们发现5对基因为片段复制,且分别位于不同的染色体,表明片段复制在膜结合ZmbHLHs数目的扩张中具有重要作用(图1和表2)。
图表编号 | XD00181502800 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.04.20 |
作者 | 丁冬、李嘉欣、魏玉磊、吕尤、赵训超、刘梦、邵文静、盖胜男、张今杰、徐晶宇 |
绘制单位 | 黑龙江八一农垦大学农学院黑龙江省现代农业栽培技术与作物种质改良重点实验室、黑龙江八一农垦大学农学院黑龙江省现代农业栽培技术与作物种质改良重点实验室、黑龙江八一农垦大学农学院黑龙江省现代农业栽培技术与作物种质改良重点实验室、黑龙江八一农垦大学农学院黑龙江省现代农业栽培技术与作物种质改良重点实验室、黑龙江八一农垦大学农学院黑龙江省现代农业栽培技术与作物种质改良重点实验室、黑龙江八一农垦大学农学院黑龙江省现代农业栽培技术与作物种质改良重点实验室、黑龙江八一农垦大学农学院黑龙江省现代农业栽培技术与作物种质改良重点 |
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