《表3 柑橘基因组中的CCD基因》

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《柑橘CCD基因家族鉴定及CcCCD4a对果肉颜色的影响》

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通过Blast比对及Hmmer搜索，SMART分析去除不含REP65结构域的序列，从柑橘基因组中共鉴定出14个CCD基因，如表3所示。通过ExPASy工具分析，柑橘中最长的CCD蛋白（Cc CCD＿like）包含611个氨基酸，分子量为69.18 kD，是14个蛋白质中分子量最大的。最短的CCD蛋白（Cc CCD4d）包含412个氨基酸，分子量是14个蛋白中最小的。等电点范围为6.05（Cc CCD1b）—8.53(CcCCD4c）。利用MBC软件对Cc CCD家族成员进行亚细胞定位分析，结果显示该基因家族成员位于细胞不同位置，其中Cc CCD1a、Cc CCD1b、Cc CCD4b2、Cc CCD8a、Cc CCD＿like、Cc NCED6定位于细胞质，其他成员定位于叶绿体。