《表3 测序数据质量情况汇总》
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《大豆RN型细胞质雄性不育育性恢复抑制基因Rf-I的遗传分析与定位》
Q20:Phred大于20的碱基占总数的百分比;Q30:Phred大于30的碱基占总数的百分比;JLCMS89A:母本;JLR92:父本;Fpool:可育池;S pool:不育池;下同
对20个BC1F2不育单株DNA和20个BC1F2可育单株DNA构建的混池及两个亲本DNA进行全基因组重测序,总共获得原始数据210.053 G,经过滤后的数据为209.826 G,Q20≥94.54%,Q30≥87.02%,GC含量35.66%~36.3%(表3),测序质量高,GC分布正常。所获得的数据与参考基因组(Williams 82)进行比对,参考基因组大小为978 416 860 bp,GC含量为34.76%,所有样本的比对率为97.28%~98.87%,对参考基因组(排除N区)的平均覆盖深度为在8.89×~37.23×,1×覆盖度(至少有1个碱基的覆盖)在97.7%以上(表4)。综上,比对结果正常,可用于后续的变异检测及相关分析。
图表编号 | XD00167964300 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.05.25 |
作者 | 李永宽、张井勇、赵国龙、李蓉、林春晶、赵丽梅、彭宝、张春宝 |
绘制单位 | 吉林农业大学农学院、吉林省农业科学院大豆研究所、大豆国家工程研究中心、吉林省农业科学院大豆研究所、大豆国家工程研究中心、吉林省农业科学院大豆研究所、大豆国家工程研究中心、吉林农业大学农学院、吉林省农业科学院大豆研究所、大豆国家工程研究中心、吉林省农业科学院大豆研究所、大豆国家工程研究中心、吉林省农业科学院大豆研究所、大豆国家工程研究中心、吉林省农业科学院大豆研究所、大豆国家工程研究中心、吉林农业大学农学院、吉林省农业科学院大豆研究所、大豆国家工程研究中心 |
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