《表4 研究中所用18对SSR引物信息》

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《玉兰亚属及其近缘种植物遗传多样性分析》


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41对SSR引物序列取自外文文献(表4)(Isagi et al.,1999;Setsuko et al.,2005),由睿博兴科公司合成。SSR引物的5'端加M13(序列:TGTAAAACGACGG CCAGT)接头,并用FAM(蓝色)荧光染料标记。通过设置比例梯度试验,确定M13引物、5'端加有M13接头序列特异正向、反向引物的最适摩尔比例为1∶3∶4。筛选41对引物在SSR反应体系中的最佳退火温度,每对引物以文献中参考温度为中心、±4℃为梯度与玉兰样本DNA进行PCR扩增(图4A)。所用DNA MarkerⅠ分子量标为100~500 bp,琼脂糖凝胶电泳检测PCR扩增产物质量。最终筛选出能跑出多态性条带的可用SSR引物18对。以来自不同亚属的样品DNA模板,筛选能够特异性识别的引物。同种SSR引物在不同样品内的扩增条带显示出不同大小(图4B)。