《表2 4种方法在不同样本规模下的功效值》

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《基于XGBoost的质量性状基因互作检测方法》

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geXGB算法的性能很大程度上取决于遗传率，即交互作用强度。随着遗传率从0.01到0.025，geXGB的统计效力成倍增加。其它方法也表现出了稳定的上升趋势（见图4）。不仅如此，方法的性能还取决于相互作用位点的MAF，例如MAF=0.2时，不同模拟数据集上统计效力范围为0.14～0.93之间，而MAF=0.4时，范围在0.66～0.93之间。前者平均效力为0.554，远低于后者的0.84。表2是4种方法在不同样本规模下的功效值，可以看出，增大样本量对方法性能有显著提升作用。