《表2 进行匹配后的差异miRNA与靶基因Tabel 2 Significantly differently expressed genes and miRNAs》
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《家族性高胆固醇血症HDL-miRNAs调节血单核细胞功能机制》
注:同一pre-miRNA前体的可以加工成两个miRNA,带“*”号的miRNA表达量较低,属隐形表达
差异基因与差异miRNA预测的靶基因做交集,得到99个交集基因。99个交集基因与miRNA进行交叉匹配(原则:交集基因为低表达,则调控该基因的miRNA为高表达;反之,交集基因为高表达,则调控该基因的miRNA为低表达),共得到74对miRNA-基因对,包括19个差异miRNA和56个差异基因(表2)。利用STRING蛋白互作数据库对56个差异基因进行互作分析。最后将19个差异miRNA与56个差异基因的调控关系,以及56个差异基因之间的相互作用关系用Cytoscape进行可视化(图2)。14个miRNA及46个差异基因可以形成较集中的互相关联的调控网络。网络中,miR-186、miR-30a、miR-223、IL7、TGFBR3处于网络的中心位置,表明这些关键靶点在单核细胞功能调控中起着重要作用。
图表编号 | XD00144689200 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.06.30 |
作者 | 丁毅、杜芬、喻红 |
绘制单位 | 武汉大学基础医学院、上海市东方医院医学超声科、武汉大学基础医学院、武汉大学基础医学院 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |