《表1 主蛋白酶靶向抑制剂》

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《基于生物信息学浅析新型冠状病毒肺炎潜在的药物研发模式》


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约306 aa长的主要蛋白酶(Mpro)是CoV复制的关键酶,也由该多肽编码,并负责将该多肽加工为功能蛋白。SARS-CoV Mpro和SARS-CoV-2 Mpro的蛋白质序列具有96%的同一性,研究[22]预测了可能通过靶向Mpro而用作SARS-CoV-2抑制剂的商业药物,这些预测药物可以与SARS-CoV-2 Mpro形成更多的氢键,有可能作为具有类似Mpro结合位点和口袋结构的CoV的抑制剂发挥作用,见表1。研究[23]基于8 000个临床药物库,通过高通量筛选,利用SeeSAR对从对接中收获的候选物深入分析了基于原子的亲和力贡献和物理化学性质,鉴定出4种与SARS-CoV主蛋白酶具有高结合能力的小分子药物:氟喹诺酮抗生素普鲁沙星,新型HCV RNA复制非核苷抑制剂(NNI)Tegobuvir,蛋白酶抑制剂Nelfinavir和HIV-1整合酶抑制剂Bictegravir,所有这些药物已被广泛用于临床应用中(非此用途),并确保了安全性,这可能可以作为有望治疗SARS-CoV-2感染的候选药物[23]。