《表4 蛋白质相互作用网络关键基因簇功能注释》

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《多个GEO芯片联合分析筛选鼻咽癌易感基因》


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用STRING10分析差异基因所对应的蛋白之间的相互作用网络,见图8;得到35个与≥29个蛋白有相互作用的蛋白,见图9。再进一步分析网络中的关键节点和基因簇,结果显示蛋白质相互作用网络中存在3个比较重要的基因簇。第1个基因簇关键节点为增殖性细胞核抗原(proliferating cell nuclear antigen,PCNA)和微小染色体维持蛋白2(minichromosome maintenance 2,MCM2),该基因簇生物功能主要富集于细胞核、细胞核质、有丝分裂细胞周期的G1/S转换、基因复制等通路;第2个基因簇关键节点为核分裂周期蛋白80(nuclear division cycle 80,NDC80)、细胞周期素B1(cyclin B1,CCNB1)、细胞周期分裂蛋白20(cell division cycle 20,CDC20),该基因簇功能主要有凝聚核染色体外动粒、浓缩核染色体动粒、有丝分裂主轴装配检查点、有丝分裂纺锤体装配;第3个基因簇包括复制因子复合体4(replication factor C subunit 4,RFC4)、复制因子复合体5(replication factor C subunit 5,RFC5)、氧化应激反应因子(Obg like ATPase 1,OLA1),该基因簇主要与腺嘌呤核苷三磷酸结合以及DNA复制相关,见图10和表4。