《表2 5个潜在的风险基因》
为了揭示AD的病理分子机制,本研究应用施泰纳最小树算法构建AD疾病特异性子网络,得到如图3所示的蛋白质互作网络结构,包含229个节点和434条边。圆形的节点代表基因,边代表基因之间的相互作用。其中一些基因是AD的易感基因,一些是通过PPIN引入的非AD基因集的基因。这些引入的新基因和不同数目的AD易感基因相互连接,根据网络中与同一类别基因相互连接的基因,可能具有相同功能的原则,引入的新基因可能是AD潜在的易感基因。同时对该网络中包含的所有基因进行了网络节点度的计算,对度和中心介数进行排名并提取前15名基因,把包含AD基因集中的基因进行剔除,最终得到5个候选易感基因(图3中蓝色圆形节点)。分别是:HSP90AB1、PRKACA、GRB2、PPP1CA、PPKN(表2)。这几个基因在网络中都具有高的节点度,即与较多基因存在相互作用关系,并且位于网络中心的位置,在网络的连接上承担了重要角色,可能是AD疾病潜在治疗靶点。这5个核心基因的主要功能集中于神经元形成、免疫应答的激活、肾上腺素反应、神经节律夹带等。
图表编号 | XD00118855100 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.12.15 |
作者 | 樊婷、王举 |
绘制单位 | 天津医科大学生物医学工程与技术学院、宁夏回族自治区人民医院肿瘤科、天津医科大学生物医学工程与技术学院 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |