《表4 String检索获取的14个潜在基因的生物功能》

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《子宫内膜癌淋巴结转移相关基因的生物信息学分析》


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通过PubMed以endometrial cancer lymph nodes metastasis为关键词进行文献搜索,发现31个已知与子宫内膜癌淋巴结转移相关的基因,其中MDM2、p21、VEGF、P53、Bcl-2、surviving、UPA、PAI-1、HSF1、XAF1、CDK4、Ki67、ER6、SKP2、NDRG1、PGP9.5、EZH2、C-erbB-2、wwox、septin-9、HER2、BRCA1、COX、TGF-1n、Mta-1、E-cad这26个基因表达上调,nm23、smac、bax、PTEN、sky这5个基因表达下调。GeneMania工具分析上述31个基因与信号通路富集获得的14个基因之间的关系(图2、表4)发现,除MAGI1、BMPR1B和SOX17基因外,其他11个基因蛋白网络中之间通过各种方式相互作用,如FGFR1与IRS1、VEFRC、ANGPT1、PLCB4直接相互作用,IRS1与FGFR1、PRLR、EIF4E直接相互作用,PRLR与IFNA1、IRS1、IL7也存在直接相互作用关系。说明筛选出的基因大部分都通过直接或间接的方式与已知的子宫内膜癌淋巴结转移相关基因相互作用形成蛋白相互作用网络,推测这些基因可能在功能上相关,从而提示筛选的基因可能也与子宫内膜癌淋巴结转移相关。