《表2 野葛和甘葛藤SSR类型及分布》

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《葛根SSR特征及江西粉葛DNA身份证的构建》


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野葛基因组1.11 Gb,共1 723 763条基因组序列,按照设置参数共检索到66 191个SSR位点。平均距离为16.8 kb,即基因组序列上每16.8 kb出现一个SSR位点。在所搜索到的SSR中,二核苷酸重复类型占比例最高(50.54%),三核苷酸重复类型所占比例为30.43%,四、五、六核苷酸重复类型所占比例均较低,分别为7.67%,7.95%,3.42%。甘葛藤基因组1.22 Gb,共1 585 206条基因组序列,按照设置参数共检索到71 968个SSR位点。平均距离为16.99kb,即基因组序列上每16.99 kb出现1个SSR位点。在所搜索到的SSR中,二核苷酸重复类型占比例最高(55%),三核苷酸重复类型所占比例为27.88%,四、五、六核苷酸重复类型所占比例均较低,分别为6.89%,7.13%,3.1%(表2)。