《表3 CRISPR-Cas系统在细菌中进行单、多基因编辑的总结》

《表3 CRISPR-Cas系统在细菌中进行单、多基因编辑的总结》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
本系列图表出处文件名:随高清版一同展现
《细菌基因组编辑技术进展》


  1. 获取 高清版本忘记账户?点击这里登录
  1. 下载图表忘记账户?点击这里登录
aCEP,Cas效应蛋白;bHDR,同源重组修复;NHEJ,非同源末端链接;cKO,敲除;KI,敲入;R-dsDNA,复制型dsDNA;NR-dsDNA,非复制型dsDNA;λRed-HDR,λRed-介导的同源重组;RecET-HDR,RecET-辅助的同源重组;ND,未测定

基因组编辑是CRISPR-Cas系统最为广泛的应用,可以通过两种方式来对细菌基因组进行CRISPR-Cas介导的编辑:(1)向宿主菌中引入异源CRISPR-Cas系统,如应用较多的来自化脓性链球菌(Streptococcus pyogenes)Cas9(spCas9);(2)利用内源的CRISPR-Cas系统,如肺炎链球菌、巴氏梭菌等具有天然的CRISPR-Cas系统[113-114]。2013年,Jiang等[113]利用CRISPR-Cas9系统分别在肺炎链球菌和大肠杆菌中实现基因修饰是CRISPR-Cas用于细菌基因组编辑的第一个例子。如今,已有多项研究报道可将CRISPR-Cas用于各种细菌的基因编辑,表3总结了迄今为止报道的34种细菌中所涉及的单、多基因编辑,其中革兰氏阳性细菌有28种,革兰氏阴性细菌有6种。在CRISPR类型方面,有30种细菌中采用了化脓链球菌来源的Cas9,4种细菌中使用了新凶手弗朗西丝菌来源的Cpf1,1种细菌中应用了表皮葡萄球菌来源的CRISPR-Cas系统,4种细菌借助的是内源的CRISPR-Cas系统。在供体DNA形式方面,有4、4和29种细菌分别采用ssDNA、非复制型dsDNA和复制型dsDNA的形式来提供修复模板,其中大肠杆菌的修复DNA可以为这三种形式之一。