《表1 温带和热带玉米群体的SNP在基因组区间的分布比例》
提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
本系列图表出处文件名:随高清版一同展现
《基于温带和热带玉米群体全基因组F_(ST)和XP-EHH的选择信号检测》
利用SnpEff软件评估温、热带玉米群体在基因组水平上的多态性情况(图1),基因组注释信息来源于B73自交系。结果表明,热带玉米染色体的SNP数目显著的高于温带群体。热带玉米群体一共鉴定到14 123 408个SNP,染色体上平均每145个碱基存在一个变异位点;在温带玉米群体中共鉴定到个8791 673个SNP,平均每234个碱基存在一个变异位点。温带和热带玉米群体一起进行SNP筛选,最终得到了204 752个符合过滤标准的SNP位点。此外,还分析了温带玉米和热带玉米群体中SNP的分布区域(表1),结果表明,温带和热带玉米群体中的SNP变异主要都发生在基因区间(Intergentic),此外依次是下游区间(Downstream)、上游区间(Upstream)、内含子区间(Intron)、外显子区间(Exon)等。
图表编号 | XD0063578500 严禁用于非法目的 |
---|---|
绘制时间 | 2019.02.16 |
作者 | 杨宇昕、邹枨 |
绘制单位 | 中国农业科学院作物科学研究所、中国农业科学院作物科学研究所 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |