《表1 温带和热带玉米群体的SNP在基因组区间的分布比例》

《表1 温带和热带玉米群体的SNP在基因组区间的分布比例》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《基于温带和热带玉米群体全基因组F_(ST)和XP-EHH的选择信号检测》


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利用SnpEff软件评估温、热带玉米群体在基因组水平上的多态性情况(图1),基因组注释信息来源于B73自交系。结果表明,热带玉米染色体的SNP数目显著的高于温带群体。热带玉米群体一共鉴定到14 123 408个SNP,染色体上平均每145个碱基存在一个变异位点;在温带玉米群体中共鉴定到个8791 673个SNP,平均每234个碱基存在一个变异位点。温带和热带玉米群体一起进行SNP筛选,最终得到了204 752个符合过滤标准的SNP位点。此外,还分析了温带玉米和热带玉米群体中SNP的分布区域(表1),结果表明,温带和热带玉米群体中的SNP变异主要都发生在基因区间(Intergentic),此外依次是下游区间(Downstream)、上游区间(Upstream)、内含子区间(Intron)、外显子区间(Exon)等。