《表5 微卫星引物序列信息》

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《大鳞副泥鳅5个野生群体的遗传多样性分析》


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微卫星分析所用引物参考已发表的文献(游翠红等,2012;李彩娟等,2014;叶竹青等,2015),根据预实验结果,选择12对扩增稳定、条带清晰、多态性较高的引物进行大鳞副泥鳅群体遗传多样性分析。在正向引物5'端分别用FAM(蓝色)、ROX(红色)、HEX(绿色)3种不同的荧光基团进行修饰,引物在上海生工生物工程股份有限公司合成。PCR扩增体系包括11.3μL dd H2O,1.5μL 10×PCR缓冲液,正、反引物各0.2μL(10μmol/L),d NTP 0.15μL(10 mmol/L),0.15μL Taq DNA聚合酶(5 U/μL),1.5μL DNA模板。PCR反应程序为95℃预变性5 min;扩增反应为33个循环:95℃变性30 s,Ta退火45 s,72℃延伸1 min;循环结束后72℃再延伸10 min。扩增产物在ABI 3730XL基因分析仪上进行分型,用GS-500LIZ作为内参,用GeneMapper 3.5软件读取个体的基因型(表5)。