《表1 七鳃鳗KCTD基因的基本信息》

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《七鳃鳗KCTD基因家族成员全基因组鉴定及进化分析》

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注:*:日本七鳃鳗缺乏转录组数据，其预测的转录本序列中不包含UTR信息；**:小鼠KCTD蛋白长度作为参考，推断七鳃鳗KCTD编码区是否完整

将Ensembl数据库下载的人、小鼠和斑马鱼KCTD基因家族成员蛋白序列作为查询序列，结合本地BLAST程序比对搜索，从海七鳃鳗基因组、转录组数据和日本七鳃鳗基因组数据鉴定出2种七鳃鳗KCTD基因家族成员。从海七鳃鳗和日本七鳃鳗数据中分别鉴定出13和14个KCTD基因，这可能是由于基因组组装不完整，在海七鳃鳗中未鉴定出KCTD9b。七鳃鳗KCTD基因的长度、转录本长度、编码序列长度、预测蛋白长度及其它信息（表1）中，除KCTD2和KCTD16外，其它11个基因的编码区序列完整，而日本七鳃鳗中5个基因（KCTD2，KCTD3，KCTD7，KCT-D9b和KCTD16）的编码区序列不完整。七鳃鳗KCTD1基因编码266个氨基酸（aa），与小鼠的KCTD1蛋白序列长度（268 aa）基本一致。七鳃鳗KCTD2编码区序列是不完整的。海七鳃鳗中编码的长度是158 aa，而日本七鳃鳗中编码序列长度（48 aa）比其更短。不完整的日本七鳃鳗KCTD3蛋白序列比海七鳃鳗完整序列短59 aa。七鳃鳗KCTD3蛋白序列明显比小鼠KCTD3序列长。相对于日本七鳃鳗，海七鳃鳗KCTD5转录本编码区2个位置各有15 bp的插入，以致造成海七鳃鳗比日本七鳃鳗KCTD5蛋白序列长10 aa。日本七鳃鳗KCTD7不完整蛋白序列比海七鳃鳗完整序列短76 aa。日本七鳃鳗中KCTD9有2个拷贝KCTD9a与KCTD9b，并且KCTD9b蛋白序列不完整；与海七鳃鳗相比，日本七鳃鳗KCTD9a蛋白短3 aa。海七鳃鳗KCTD10和KCTD12蛋白序列长度分别331 aa和317 aa，比日本七鳃鳗蛋白序列长3 aa。海七鳃鳗和日本七鳃鳗KCTD11蛋白序列相差1个氨基酸。七鳃鳗KCTD16蛋白序列都为不完整序列，分别为417aa和409 aa。七鳃鳗KCTD19编码氨基酸序列都为421 aa。海七鳃鳗和日本七鳃鳗Btbd10蛋白完整序列相差4个氨基酸，明显比小鼠Btbd10蛋白序列长。