《表3 金沙柚WRKY基因序列分析Tab.3 Analysis sequence of Tinsha pomelo’s WKRY》

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《铝胁迫下金沙柚3个WRKY基因的生物信息学与表达分析》

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利用生物信息学方法对获得的能显著响应铝胁迫的3个WRKY基因CgWRKY40、CgWRKY70-1和CgWRKY70-2（Cg4g001470、Cg7g003890和Cg6g010690）进行预测分析，序列分析结果（表3）显示，3个WRKY基因编码的蛋白均为不稳定蛋白，均为水溶性蛋白。开放阅读框长度分别为966、933和993 bp，各编码321、310和330个氨基酸，理论PI值分别为6.56，分子量分别为36.1、35.2和37.0 ku。根据WRKY结构域，锌指结构型特点可知，CgWRKY40包含一个WRKY结构域，结构为CX4-5CX22-23HX1H，属第IIa类；CgWRKY70-1和CgWRKY70-2WRKY的结构为CX7CX23HX1H均属于第III a类。信号肽预测表明CgWRKY40、CgWRKY70-1，CgWRKY70-2蛋白都没有信号肽。利用Wolf psort在线预测3个基因的亚细胞定位，均定位于细胞核上。