《表1 668株结核分枝杆菌Spoligotyping结果》
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《河南省结核分枝杆菌MIRU-VNTR和间隔区寡核苷酸分型分析》
668个菌株共分成了35个不同的基因型。8株的SIT与SpolDB 4.0数据库及其升级版本SITVIT两个数据库中所有已鉴定菌株均不匹配,因此被定义为未知菌株。北京型家族基因型菌株有558(83.53%)株,其中546株为典型北京型家族基因型(SIT1),表现为前34个间隔区缺失,只存在35~43个间隔区[11];剩余12株由于缺失1个或多个在经典北京型家族存在的间隔区,被定义为类北京型菌株或非典型北京型菌株。其次是T1家族基因型和MANU2基因型,分别有59(8.83%)株和20(2.99%)株。北京型和T1、MANU2基因型是该地区主要流行菌株,占总体菌株的95.35%。其余的110株非北京型菌株被分为28个基因型。668株通过成簇分析最终被划分为10个簇,25个菌株具有独特的Spoligotype基因型。由于Spoligotyping对北京型家族分辨能力差,成簇率较高,达94.7%(表1)。
图表编号 | XD0052403700 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.05.20 |
作者 | 石洁、郑丹薇、朱岩昆、马晓光、王少华、李辉、张国龙 |
绘制单位 | 河南省疾病预防控制中心、河南省疾病预防控制中心、河南省疾病预防控制中心、河南省疾病预防控制中心、河南省疾病预防控制中心、河南省疾病预防控制中心、河南省疾病预防控制中心 |
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