《表1 鹰嘴豆NF-Y基因家族成员信息》

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《鹰嘴豆NF-Y基因家族的全基因组序列鉴定及生物信息学分析》


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为了鉴定鹰嘴豆NF-Y基因,使用拟南芥NF-Y的氨基酸序列进行比较,将鹰嘴豆与拟南芥中相似性高的序列作为同系进行命名(表1)。利用MEGA 5.0和DNAMAN 8.0软件,对鹰嘴豆NF-Y基因家族41个成员的氨基酸序列进行分析,发现NF-Y基因家族的41个成员分为8个NF-YA、22个NF-YB和11个NF-YC。根据鹰嘴豆基因位置信息,在7条(Ca1—Ca7)染色体上定位了38个NF-Y基因,1号和4号染色体上基因最多,都含有8个NF-Y成员,其次是7号染色体,含有7个基因,2号染色体上分布最少,另外还有3条序列未定位到染色体上。蛋白质生物信息学分析发现,分子质量最大的是CarNF-YC2蛋白,为104.364 0 ku,最小的是CarNF-YC5蛋白,为12.598 6 ku。鹰嘴豆NF-Y蛋白中CarNF-YC2含有924个氨基酸残基,CarNF-YC5仅有114个氨基酸残基。鹰嘴豆NF-Y基因家族41个成员编码的蛋白质等电点介于4.185 1~10.319 1(表1)。