《表3 JA缺失突变体def1、spr2及其野生型CM的Illumina测序数据统计表》

《表3 JA缺失突变体def1、spr2及其野生型CM的Illumina测序数据统计表》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《番茄茉莉酸缺失突变体灰霉菌侵染响应miRNA及其表达分析》


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如表3所示,番茄CM、def1和spr2接种灰霉菌0和48 h得到的过滤后序列占原始序列的87.23%;样品中未注释的序列居多,达90%;rRNA、tRNA、snRNA、snoRNA所占比重较少,符合建库要求,可进行下一步分析。接菌0和48 h,CM、def1、spr2比对到正链上的过滤后序列数占所有锚定序列(mapped reads)的比例分别为50.62%、50.36%、50.07%、50.18%、62.32%、50.60%(表4)。过滤后序列进行miRNA片段长度统计(图2),各处理miRNA长度在21~24 nt的丰度较高,且不同品种不同处理之间miRNA的长度峰值略有差异。其中长度24 nt的miRNA占比最高,平均为33.92%。