《表3 JA缺失突变体def1、spr2及其野生型CM的Illumina测序数据统计表》
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《番茄茉莉酸缺失突变体灰霉菌侵染响应miRNA及其表达分析》
如表3所示,番茄CM、def1和spr2接种灰霉菌0和48 h得到的过滤后序列占原始序列的87.23%;样品中未注释的序列居多,达90%;rRNA、tRNA、snRNA、snoRNA所占比重较少,符合建库要求,可进行下一步分析。接菌0和48 h,CM、def1、spr2比对到正链上的过滤后序列数占所有锚定序列(mapped reads)的比例分别为50.62%、50.36%、50.07%、50.18%、62.32%、50.60%(表4)。过滤后序列进行miRNA片段长度统计(图2),各处理miRNA长度在21~24 nt的丰度较高,且不同品种不同处理之间miRNA的长度峰值略有差异。其中长度24 nt的miRNA占比最高,平均为33.92%。
图表编号 | XD00178093700 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.07.25 |
作者 | 李琳琳、金华、刘斯超、邹吉祥、李天来 |
绘制单位 | 大连民族大学环境与资源学院、大连民族大学环境与资源学院、承德市蔬菜技术推广站、大连民族大学环境与资源学院、沈阳农业大学园艺学院设施园艺省部共建教育部重点实验室 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |