《表2 LM1212-DB菌株染色体基因组中缺失基因列表》
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《苏云金芽胞杆菌LM1212菌株和突变株的全基因组序列比较分析》
对LM1212菌株和突变株LM1212-DB的染色体基因组进行比较分析发现,位于LM1212菌株染色体基因组的2 607 455 bp与2 682 965 bp之间的片段在LM1212-DB菌株中缺失。染色体基因组的缺失片段共含有69个开放阅读框(open reading frame,ORF):4个ORF被注释为转座酶,值得注意的是,位于缺失片段的首末均为同一个转座酶,这可能是导致该片段缺失的原因;38个ORFs被注释为未知功能的假想蛋白基因;31个ORFs被注释为各类别的功能基因,可将这些缺失的功能基因分为2类:一类基因是在基因组未缺失区域仍存在与此基因功能相似或相同的基因;另一类基因是在L-M1212DB菌株中仅存在唯一的拷贝且丢失(表2)。
图表编号 | XD00174028400 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.06.20 |
作者 | 佟蕾、张睿彬、彭琦、张杰、Lereclus Didier、宋福平 |
绘制单位 | 中国农业科学院植物保护研究所植物病虫害生物学国家重点实验室、中国农业科学院植物保护研究所植物病虫害生物学国家重点实验室、INRAUMR1319 Micalis、中国农业科学院植物保护研究所植物病虫害生物学国家重点实验室、中国农业科学院植物保护研究所植物病虫害生物学国家重点实验室、INRAUMR1319 Micalis、中国农业科学院植物保护研究所植物病虫害生物学国家重点实验室 |
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